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PCR基因扩增实验室

发布时间:2017-11-15 11:04

PCR基因扩增实验室介绍和标准:
   PCR实验室又叫基因扩增实验室。PCR是聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction)的简称。是一种分子生物学技术,用于放大特定的DNA片段,可看作生物体外的特殊DNA复制。通过DNA基因追踪系统,能迅速掌握患者体内的病毒含量,其精确度高达纳米级别。
PCR实验室必须建立严格的实验室管理制度、建立标准化操作程序(SOP)、建立系列质量管理文件等,确保实验室日常运行符合国家卫生部的要求,确保检测结果准确、确保实验室卫生安全,确保实验室长期稳定运行.
                     PCR实验室

PCR设计规范 /PRINCIPLES

配置原则 室全PCR线实验(高档实验室) 标准PCR实验室(中档实验室) 普通实验室(普通实验室) 测序实验室(专科实验室)
开展项目            涵盖了目前分子生物学能开展所有项目,达到国内甚至国际一流CR实验室水平。 检测项目齐全,涵盖了目前临床需求的常规检测项目,达到国内PCR标准实验室的检测水平。 临床科室或小型医院开展PCR项目,检测项目满足临床需求,达到或达不到国内PCR标准实验室的标准。 开展测序的所有检测项目,达到标准PCR实验室水平
项目先进性            除开展常规的检测项目外,还需开展高端项目,如测序项目、超敏PCR项目、肿瘤检测等高端项目。 开展项目技术性能基本满足临床需求,达到国内PCR标准实验室的检测水平。 开展项目技术性只能满足科室或小型医院的当前需求,不具有先进性。 国内外最先进的PCR测序检测项目,达到个体化诊疗的需求。
人员要求            至少有两人,除经过普通PCR上岗培训外,要具有测序项目检测实验及结果分析能力。 至少有两人,除经过普通PCR上岗培训外,要具有测序项目检测实验及结果分析能力。 至少有两人,除经过普通PCR上岗培训外,要具有测序项目检测实验及结果分析能力。 至少有两人,除经过普通PCR上岗培训外,要具有测序项目检测实验及结果分析能力。
 
 
PCR基因扩增实验室技术参数
 
区域 压力 温度 相对湿度 照明
PCR走廊 +5-0Pa 20-26度 40-60%RH 主实验室≥300LX,其余房间20-300LX
PCR试剂准备区 +10Pa
PCR样品制备区 +15Pa
PCR扩增及扩增产物分析区 -15-250Pa
 
基因扩增检验实验室平面布局
 1临床基因扩增检验实验室区域设置原则
1、 试剂储存和准备区                                                          
2、 标本制备区
PCR实验室试剂准备区PCR产物扩增区
3、 扩增反应混合物配制和扩增区                                4、 扩增产物分析区
PCR扩增区PCR产物分析区

如使用全自动分析仪,区域可适当合并。
2 各工作区域必须有明确的标记,避免不同工作区域内的设备、物品混用
3 进入各工作区域必须严格按照单一方向进行,即试剂储存和准备区 —>标本制备区—>扩增反应混合物配制和扩增区—>扩增产物分析区。
 4 不同的工作区域使用不同的工作服(例如不同的颜色)。工作人员离开各工作区域时,不得将工作服带出。
 
PCR实验室平面图
 
                       PCR基因扩增实验室平面图
 
PCR扩增检验实验室3D立体图
PCR扩增检验实验室原则上分为三个单独的工作区域:试剂贮存和准备区、标本制备区、扩增和扩增产物分析区。为避免交叉污染,进入各个工作区域必须严格遵循单一方向进行,即只能从试剂贮存和准备区→标本制备区→扩增和扩增产物分析区。各实验区之间的试剂及样品传递应通过传递窗进行。
PCR实验室准备区
(1)试剂贮存和准备区
该实验区主要进行的操作为贮存试剂的制备、试剂的分装和主反应混合液的制备。试剂和用于样品制作的材料应直接运送至该区,不得经过其他区域。试剂原材料必须贮存在本区内,并在本区内制备成所需的贮存试剂。对与气流压力的控制,本区应对外界保持微正压。

 PCR标本制备区
  (2)标本制备区
该区域主要进行的操作为样本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、贮存及其加入至扩增反应管和测定DNA的合成。本区的压力梯度要求为:相对于邻近区域为正压,以避免从邻近区进入本区的气溶胶污染。另外,由于在加样操作中可能会发生气溶胶所致的污染,所以应避免在本区内不必要的走动。
 
 
PCR扩增和扩增产物分析区
(3-4)扩增和扩增产物分析区
  该区域主要进行的操作为DNA扩增和扩增片段的测定。此外,已制备的DNA模板(来自样本制备区)的加入和主反应混合液(来自试剂贮存和制备区)制备成反应混合液等也可在本区内进行。本区的压力梯度要求为:相对于邻近区域为负压,以避免气溶胶从本区漏出。为避免气溶胶所致的污染,应尽量减少在本区内的不必要的走动。个别操作如加样等应在超净台内进行。
 
PCR实验室扩增产物分析区
 
 
   PCR区完成以后,需要分析样品并解释数据,应该留出一个专门用于反应后处理样品的地方。后PCR活动中使用的所用试剂、一次性耗材和仪器都必须是专门用于这一目的,决不能把实验室这一区域的试剂或仪器用于任何前PCR活动。产物分析区如使用全自动分析仪,区域可适当合并。

PCR产物分析区2.png

(5)缓冲区与冲洗区
整个区域有一个整体缓冲走廊。每个独立实验区设置有缓冲区,同时各区通过气压调节,使整个PCR实验过程中试剂和标本免受气溶胶的污染并降低扩增产物对人员和环境的污染。
 
PCR人员通道19.png
 
   可打开缓冲区Ⅰ,缓冲区Ⅱ和 PCR 扩增区的排风扇往外排气,在实验区的外墙上和各扇门上都安装有风量可调的回风口,空气通过回风口向室内换气。外面有用于实验后消毒,消毒区域有专用清洗液和专用洁净洗手池,以及消毒纸巾。
 
PCR实验室缓冲区2.png
 
若房间进深允许,可设PCR内部专用走廊。需要指出的是在减少室内外空气交换方面,缓冲间比专用走廊更有意义。
    各个区域之间应具备单向的实验工艺流、物流、人流与气流,形成单向流程的保护屏障,避免实验之间的相互干扰,防止核酸气溶胶对实验过程造成污染产生假性结果。 

PCR冲洗区55.png
 
PCR实验室案例欣赏

以下为科瓦特设计的疾控中心PCR基因扩增实验室的整体建设: 
1、主体结构:
主体为彩钢板、铝合金型材。室内所有阴角、阳角均采用铝合金50内圆角铝,从而解决容易污染、积尘、不易清扫等问题。结构牢固,线条简明,美观大方,密封性好。
 2、 标准的三区分隔和气压调节:
将PCR过程分成试剂准备、标本制备和PCR扩增、分析三个(或)四个独立的实验区。整个区域有一个整体缓冲走廊。每个独立实验区设置有缓冲区,同时各区通过气压调节,使整个PCR实验过程中试剂和标本免受气溶胶的污染并降低扩增产物对人员和环境的污染。
可打开缓冲区Ⅰ,缓冲区Ⅱ和 PCR 扩增区的排风扇往外排气,在实验区的外墙上和各扇门上都安装有风量可调的回风口,空气通过回风口向室内换气。
 3、 消毒:
在三个实验区和三个缓冲区顶部以及传送窗内部安装有紫外灯,供消毒用。 在试剂准备区和标本制备区 还设置移动紫外线灯,对实验桌进行局部消毒。
4、 机械连锁不锈钢传递窗:
试剂和标本通过机械连锁不锈钢(不建议使用电子连锁方式)传递窗传递,保证试剂和标本在传递过程中不受污染(人物分流)。
5、 地面
地面建议使用PVC卷材地面或自流坪地面,整体性好。便于进行清扫,耐腐蚀。没有条件的也可采用水磨石地面,或大块的瓷砖(至少800mm×800mm)接缝需要小于2mm。
 6、 照明
灯具要选用净化灯具,能达到便于清洗、不积尘的特点。

科瓦特PCR实验室案例展示:
PCR实验室细节图PCR产物分析区

                      生物安全标识                                                   产物扩增区
PCR实验室产物分析区PCR缓冲区
                        PCR标本制备区                                         PCR缓冲区
PCR洗手消毒区PCR换衣处

                            PCR洗手消毒区                                          PCR沐浴换衣区
PCR通风与消防区PCR控制系统
   PCR通风与消防区 (不同区域工作人员衣服不同)                    PCR负压控制区

在建设的过程中应注意
●规范的安装流程和全面的服务流程。
●严格按照规范科学设计的安装流程。
●安装前需要确定以下安装条件,如:电源电压,电源进线位置,电话网络线进线位置,进水水压,最小安装空间,地面平整度,通风孔、进水管和下水管的位置等,理想状态的空间尺寸和通风口尺寸。 
 
 
PCR 即聚合酶链式反应,是分子生物学研究和实验的常规方法,也是生物学、医学临床等领域广泛应用的实验技术。其特点是能将微量的DNA大幅增加。实验室分为四个区域,进入各工作区域必须严格按照单一方向进行,不同的工作区域使用不同的工作服(例如不同的颜色)。工作人员离开各工作区域时,不得将工作服带出,
 
PCR整体实验室区域分别为:
 1.试剂配制区
 2.样品处理区
3.核酸扩增区
 
PCR实验室可以是分散形式,也可以是组合形式。完成一组PCR实验,通常应经过试剂配制、样品处理、核酸扩增及产物分析四个实验过程,若实验工艺需要,还应增加样品粉碎过程。
一、分散形式PCR实验室
    所谓分散形式PCR实验室,是指完成上述实验过程的实验用房彼此相距较远,呈分散布置形式。对于这种布置形式的PCR实验室,由于各个实验之间不易相互干扰,因此无需特殊条件要求。
       
 分散式PCR实验室
二、组合形式PCR实验室
    所谓组合形式PCR实验室, 是指完成PCR四个实验过程的实验用房相邻布置,组成独立实验区域的形式。对于组合形式PCR实验室,由于各个实验间集中布置,容易造成相互干扰,因此,对总体布局以及屏障系统具有一定的要求。各室在入口处设缓冲间,以减少室内外空气交换。试剂配制室及样品处理室宜呈微正压,以防外界含核酸气溶胶的空气进入,造成污染;核酸扩增室及产物分析室应呈微负压,以防含核酸的气溶胶扩散出去污染试剂与样品。
如果使用荧光PCR仪,扩增室和产物分析室可以合并。
    若房间进深允许,可设PCR内部专用走廊。需要指出的是在减少室内外空气交换方面,缓冲间比专用走廊更有意义。
    各个区域之间应具备单向的实验工艺流、物流、人流与气流,形成单向流程的保护屏障,避免实验之间的相互干扰,防止核酸气溶胶对实验过程造成污染产生假性结果。  
实验室的墙体,包括顶棚,应结构牢固、气密性好;所有阴角宜采用圆弧形线条过渡;墙体内壁光洁、不吸附、耐腐蚀、易清洗消毒;地面材料应满足无缝隙、无渗漏、光洁、耐腐蚀的要求.。
 
 
组合式PCR实验室
 
PCR实验室设置和验收
  拟设置临床基因扩增检验实验室的医疗机构按照《临床基因扩增检验实验室基本设置标准》筹建实验室;筹建完成后,由法定代表人向卫生部临检中心提出技术验收申请。
申请时需提交以下材料:
(一)《医疗机构执业许可证》复印件;
(二)可行性研究报告;
1、 拟设临床基因扩增检验实验室机构的所在地医疗卫生资源状况、本机构的基本情况、对临床基因扩增检验的需求以及临床基因扩增实验室运行的预测分析;
2、 拟设临床基因扩增检验实验室的设置平面图;
3、 拟设临床基因扩增检验实验室将开展的检验项目、实验设备条件和有关技术人员资料
PCR实验室验收条件
1 根据卫生部临检中心规定,凡是根据需要开展PCR检测实验室建设的医疗机构均通过卫生临床检验中心实验室验收并取得合格证书方可开展工作。二级以上医院方可设立PCR实验室,含专科医院。
2验收规定
三级医院由卫生部临床检验中心组织专家(一般均为各省临床检验中心主任)进行,二级医院由各个省临床检验中心组织专家(一般为本省医疗机构主任级别专家)进行验收。按照《临床基因扩增检验实验室基本设置标准》对提出申请的临床基因扩增检验实验室进行技术验收。验收完成后,在20日内将验收报告寄送至申请机构。
验收人员组成:一个验收小组一般为3人,其中一人为联络小组组长,其他为其他省临床检验中心主任或者本省医院内任职专家。
PCR实验室所在科室规定:根据规定,PCR检测应该由各医院的检验科开展,其他科室如传染科,皮肤科等,要求开展并申请验收的,应该事先由各省临床检验中心认可。
PCR实验室人员规定:根据规定,PCR实验室操作人员至少2名,且有PCR上岗培训合格证。
PCR实验室设备:PCR实验室内所需要的医疗设备均需要取得相关医疗器械注册许可证,检测试剂均需要取得新药证书和药品生产文号,荧光定量PCR不得使用超过五年。
PCR实验室认证实施规定
PCR实验室认证验收时,均会给定未知标本5份(一般是HBV-DNA,可能是近一两年的卫生部临床检验中心室间质控品),要求待认证实验室做实验并打印报告单作为验收的重要实验依据。一般要求5份标本的定量结果必须在范围值之内,否则不合格。
 

PCR实验室各区域管理规定

试剂准备区工作制度  
 一、实验人员进入该区须更换工作服,穿本区专用绿色工作服, 戴帽子、口罩及更换专用拖鞋。 
二、实验员在试剂准备区接收标本、准备实验用的试剂。
 三、实验员每天收齐标本,验收登记后,将标本通过传递 窗送入标本制备区。  四、在试剂准备区配置好试剂后放入冰箱内备用。需要时 通过传递窗送入标本制备区。 
五、每天的标本及配置的试剂须登记记录,应书写工整详 细,使用本区专用的、带有本室标识的记录本、纸和笔。
 六、将本区废弃物装入本室垃圾袋中,有专人将垃圾带出 实验室交医院集中处理。
 七、实验后须使用含氯消毒液及75%的乙醇擦拭实验台 面,紫外灯消毒30分钟,记录紫外灯、冰箱、离心机等仪器的使用情况。
 
  
PCR筛查检测工作人员    
 标本制备区工作制度   
 一、实验人员进入该区须更换工作服,穿上本区专用蓝色工作服, 戴帽子、口罩及更换专用拖鞋。
 二、把已准备好的试剂放入冰箱试剂存放专区暂存。
 三、记录温湿度计读数、冰箱的温度。
 四、严格按照SOP文件及试剂盒要求进行实验操作,加样好的PCR 管须通过传递窗送入扩增及产物区。
 五、使用本区专用的移液器及吸头,使用过的离心管、吸头须置于 盛有含氯消毒液的废液缸中,实验完毕后及时处理。将本区废弃物装入本室垃圾袋中,有专人将垃圾带出实验室交医院集中处理。
 六、使用本区专用的带有本区标识的记录本、纸和笔,其他区的用 品不得带入本区。 
七、实验完毕关闭所有仪器,记录仪器使用时间和运行状态。
 八、实验后须使用含氯消毒液及75%的乙醇擦拭实验台 面,紫外灯消毒30分钟,记录紫外灯、冰箱、离心机等仪器的使用情况。     
 PRC产物分析工作人员
扩增及产物分析区工作制度  
  一、实验人员进入该区须更换工作服,穿上本区专用粉红色 工作服,戴帽子、口罩及更换专用拖鞋。
 二、记录温湿度计读数、冰箱的温度。
 三、本区主要进行目的基因的扩增及分析,须熟悉各扩增仪 的使用,扩增分析完后,记录结果。
 四、得到当天室内质控结果后,及时记录在室内质控图上并 进行分析。
 五、试验完毕后关掉扩增仪,记录仪器使用时间和运行状态。
 六、每周由实验室负责人对进行清洁维护并记录。
 七、扩增分析完后的反应管,须装入本室垃圾袋中,有专人 将垃圾带出实验室交医院集中处理。 
八、使用本区专用的带有本区标识的记录本、纸和笔,其他区的用 品不得带入本区。
 九、实验后须使用含氯消毒液及75%的乙醇擦拭实验台面,紫外灯消毒30分钟,记录紫外灯、冰箱、离心机等仪器的使用情况。
 
 
PCR实验室标本制备工作人员
 
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